エピックミッションにおける寄付の割合はどのように計算されていますか？

寄付の割合と艦隊メンバーの寄付の状態は、どちらも同じタイミングで計算されています。寄付の割合は独立して計算されているわけではなく、資源によって寄付の割合が異なります。エネルギー > 惑星の資源 = 食料 > コイン という形になります。

例：（コインと食料の寄付の割合が 1:2 とした場合）
ステージ 1 >> 150,000 コイン
寄付の割合は以下のように計算されます
メンバー 1：100,000 コイン寄付、67%
メンバー 2：50,000 コイン寄付、33%
メンバー 3：寄付しない、0%
メンバー 4：寄付しない、0%

ステージ 2 >> 15,000 食料
寄付の割合のトータルは以下のように計算されます（ステージ 1 の割合も含む）
メンバー 1：7,500 食料寄付、64%
メンバー 2：寄付しない、28%
メンバー 3：5,500 食料寄付、6%
メンバー 4：2,000 食料寄付、2%

エピック艦隊の寄付の総割合が 100%になっていません。これはバグですか？

こちらはバグではなく、エピックの不正利用を防ぐために設定されています。メンバーが自ら艦隊をやめた場合や艦長によってメンバーが艦隊から追い出された場合、寄付はリセットされません。エピックから正しい報酬を獲得するため、エピックを最後まで終わらせることのできるような人たちと協力するのが重要となります。

知らない人が艦隊に入るのを防ぎたい場合は、艦隊の設定で「招待のみ」を有効にして、友達だけに招待状を送りましょう。